Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rd3lB2RV38 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rd3lB2RV38 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms