Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Abcc8B2RUS7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Abcc8B2RUS7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Abcc8B2RUS7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Abcc8B2RUS7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
Abcc8B2RUS7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Abcc8B2RUS7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms