Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zscan5bB2RTN3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Zscan5bB2RTN3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zscan5bB2RTN3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms