Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apol7aB2RT54 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apol7aB2RT54 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms