Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Znf518aB2RRF6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Znf518aB2RRF6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Znf518aB2RRF6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Znf518aB2RRF6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Znf518aB2RRF6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Znf518aB2RRF6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms