Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Phf3B2RQG2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Phf3B2RQG2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Phf3B2RQG2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms