Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mbd5B1AYB6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Mbd5B1AYB6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mbd5B1AYB6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms