Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Phactr2B1AVP0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phactr2B1AVP0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms