Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scml2B1AVB3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms