Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtpruB1AUH1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtpruB1AUH1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtpruB1AUH1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PtpruB1AUH1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PtpruB1AUH1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtpruB1AUH1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms