Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700084M14RikB1AT01 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700084M14RikB1AT01 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms