Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp36B1AQJ2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp36B1AQJ2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms