Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Skint5A7XUY5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Skint5A7XUY5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms