Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prss40A6H6T1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prss40A6H6T1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prss40A6H6T1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms