Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc9bA3KGF9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc9bA3KGF9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms