Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Xlr4aA2BI40 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xlr4aA2BI40 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xlr4aA2BI40 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms