Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Samt1A2BED8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms