Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef25A2ASI9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms