Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttll9A2APC3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ttll9A2APC3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttll9A2APC3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms