Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GabreA2AMW3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms