Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ambra1A2AH22 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ambra1A2AH22 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms