Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc163A2AGD7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc163A2AGD7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc163A2AGD7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms