Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frmpd4A2AFR3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frmpd4A2AFR3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmpd4A2AFR3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms