Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprfA2A8L5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprfA2A8L5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprfA2A8L5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprfA2A8L5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprfA2A8L5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprfA2A8L5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprfA2A8L5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprfA2A8L5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprfA2A8L5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprfA2A8L5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprfA2A8L5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprfA2A8L5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprfA2A8L5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprfA2A8L5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprfA2A8L5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprfA2A8L5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprfA2A8L5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprfA2A8L5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprfA2A8L5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms