Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlrp1bA1Z198 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp1bA1Z198 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp1bA1Z198 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms