Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc173A0JLY1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc173A0JLY1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms