Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc112A0AUP1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc112A0AUP1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms