Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms