Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIW3

Frmpd3, FERM and PDZ domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd3A0A140LIW3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd3A0A140LIW3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Frmpd3A0A140LIW3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmpd3A0A140LIW3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms