Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ9

Ighv1-12, Immunoglobulin heavy variable V1-12 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-12A0A0A6YXJ9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms