Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WNZ6

1700025B11Rik, RIKEN cDNA 1700025B11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700025B11RikA0A087WNZ6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700025B11RikA0A087WNZ6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms