Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Hdac5Q9Z2V6 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms