Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sema6cQ9WTM3 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms