Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rabgef1Q9JM13 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
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