Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trim2Q9ESN6 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trim2Q9ESN6 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms