Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
OtofQ9ESF1 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms