Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Clstn1Q9EPL2 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Clstn1Q9EPL2 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Clstn1Q9EPL2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Clstn1Q9EPL2 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Clstn1Q9EPL2 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Clstn1Q9EPL2 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Clstn1Q9EPL2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Clstn1Q9EPL2 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 Atp7b-201ENSMUST00000006742 6505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Clstn1Q9EPL2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Clstn1Q9EPL2 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clstn1Q9EPL2 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Clstn1Q9EPL2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clstn1Q9EPL2 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clstn1Q9EPL2 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Clstn1Q9EPL2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clstn1Q9EPL2 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clstn1Q9EPL2 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clstn1Q9EPL2 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Clstn1Q9EPL2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clstn1Q9EPL2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clstn1Q9EPL2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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