Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pop5Q9DB28 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms