Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Celf2-213ENSMUST00000150624 2332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gtf3c6Q9D8P7 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gtf3c6Q9D8P7 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gtf3c6Q9D8P7 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gtf3c6Q9D8P7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gtf3c6Q9D8P7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Gtf3c6Q9D8P7 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Tle3-208ENSMUST00000160882 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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