Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Derl3Q9D8K3 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms