Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nop56Q9D6Z1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms