Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufs4Q9CXZ1 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ndufs4Q9CXZ1 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ndufs4Q9CXZ1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ndufs4Q9CXZ1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ndufs4Q9CXZ1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ndufs4Q9CXZ1 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms