Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Khdc3Q9CWU5 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms