Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms