Protein–RNA interactions for Protein: Q91W86

Vps11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps11Q91W86 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vps11Q91W86 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms