Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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