Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Rsl24d1-203ENSMUST00000165177 597 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm24180-201ENSMUST00000179961 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 1110017D15Rik-202ENSMUST00000095126 884 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm14853-201ENSMUST00000116081 549 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 E330020D12Rik-203ENSMUST00000188717 766 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm7251-201ENSMUST00000182661 1009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Spin3-ps-201ENSMUST00000192825 770 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Ang2-202ENSMUST00000228835 896 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Htr1b-201ENSMUST00000051005 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm16499-201ENSMUST00000204648 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hecw1Q8K4P8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms