Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc29Q80VM3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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