Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 C8b-202ENSMUST00000065072 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 0610037L13Rik-203ENSMUST00000106726 515 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Mir6981-201ENSMUST00000184293 115 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm37016-201ENSMUST00000195507 660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm19668-201ENSMUST00000178581 747 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Tdrkh-203ENSMUST00000196386 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 CT025689.5-201ENSMUST00000224316 986 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Gm44547-201ENSMUST00000207793 1446 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NischQ80TM9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NischQ80TM9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms