Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ccdc88cQ6VGS5 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ccdc88cQ6VGS5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ccdc88cQ6VGS5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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